More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1118 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  87.35 
 
 		 570 aa  1002    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 584 aa  1174    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.69 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  43.39 
 
 		 579 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 		 577 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  40.92 
 
 		 578 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.01 
 
 		 547 aa  277  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 		 485 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  34.28 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  33.69 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.33 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.38 
 
 		 481 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  34.3 
 
 		 489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 		 472 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  35.32 
 
 		 489 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 		 485 aa  214  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 		 488 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.85 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 		 504 aa  210  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 		 473 aa  208  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.85 
 
 		 487 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  32.76 
 
 		 470 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.36 
 
 		 458 aa  203  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 		 493 aa  203  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  31.23 
 
 		 921 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.39 
 
 		 972 aa  196  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 		 480 aa  193  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.15 
 
 		 490 aa  190  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.01 
 
 		 491 aa  191  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 		 482 aa  187  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.14 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  31.49 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.72 
 
 		 491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  31.19 
 
 		 933 aa  184  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 		 490 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  31.49 
 
 		 488 aa  179  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 954 aa  179  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 924 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 487 aa  174  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 486 aa  174  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  29.96 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.4 
 
 		 481 aa  172  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  32.24 
 
 		 491 aa  171  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 642 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  30.85 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  31.29 
 
 		 493 aa  160  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 636 aa  156  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.1 
 
 		 639 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  30.06 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  28.7 
 
 		 701 aa  154  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 		 643 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 		 490 aa  153  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 		 486 aa  153  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.09 
 
 		 610 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  29.98 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  26.96 
 
 		 557 aa  148  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.8 
 
 		 647 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 603 aa  146  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 582 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  30.06 
 
 		 489 aa  144  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  26.62 
 
 		 586 aa  143  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 645 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 		 630 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  27.55 
 
 		 557 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 		 636 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 		 633 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  27.96 
 
 		 574 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 		 709 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  26.44 
 
 		 619 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  25.16 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  28.35 
 
 		 553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 		 645 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 		 634 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  30.6 
 
 		 640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  28.65 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.45 
 
 		 629 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 630 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  27.55 
 
 		 622 aa  131  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  28.63 
 
 		 684 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.36 
 
 		 629 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.36 
 
 		 629 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  24.31 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 631 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  30.27 
 
 		 615 aa  129  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 609 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>