14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1099 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1099  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 872 aa  1736    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000342795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1100  glycosyl transferase family protein  86.46 
 
 		 628 aa  1004    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000283415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2055  glycosyl transferase family protein  40.86 
 
 		 729 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.265911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1101  hypothetical protein  40.8 
 
 		 544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000465814  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2471  hypothetical protein  31.84 
 
 		 776 aa  94.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1031  hypothetical protein  31.08 
 
 		 893 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  35.09 
 
 		 869 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0403  hypothetical protein  32.76 
 
 		 893 aa  51.2  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  35.04 
 
 		 826 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  28.84 
 
 		 688 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  29.72 
 
 		 705 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  34.21 
 
 		 860 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.460325 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1634  hypothetical protein  25.77 
 
 		 789 aa  45.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 680 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>