95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1069 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  511  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  82.17 
 
 
258 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  81.01 
 
 
244 aa  415  1e-115  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  77.13 
 
 
230 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  71.71 
 
 
217 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  67.45 
 
 
222 aa  342  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  57.49 
 
 
243 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  76.27 
 
 
245 aa  282  3e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  54.25 
 
 
250 aa  273  2e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  54.25 
 
 
250 aa  273  2e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  1.36516e-06  unclonable  2.39983e-09 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  72.43 
 
 
259 aa  273  2e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  72.43 
 
 
245 aa  273  2e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  71.89 
 
 
245 aa  272  4e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  54.25 
 
 
229 aa  272  4e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  54.29 
 
 
229 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  54.9 
 
 
229 aa  269  3e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  71.35 
 
 
259 aa  269  3e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  53.44 
 
 
230 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  54.62 
 
 
232 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  52.21 
 
 
260 aa  260  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  63.5 
 
 
200 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  67.03 
 
 
265 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  53.69 
 
 
248 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  53.69 
 
 
248 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  51.06 
 
 
239 aa  253  2e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  50.61 
 
 
217 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  51.02 
 
 
217 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  51 
 
 
218 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  49.6 
 
 
227 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  52.17 
 
 
232 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  37.35 
 
 
251 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  34.83 
 
 
274 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  63.01 
 
 
114 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  31.87 
 
 
225 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  32.29 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  29.92 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.71 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  33.63 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  30.94 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  37.85 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  30.92 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  30.92 
 
 
252 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  2.13894e-05  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  31.07 
 
 
284 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  33.21 
 
 
272 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  31.19 
 
 
222 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  30.53 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  28.79 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  31.49 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  41.59 
 
 
287 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  28.18 
 
 
241 aa  84.3  2e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  28.18 
 
 
241 aa  84.3  2e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  35.26 
 
 
249 aa  82  9e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  35.84 
 
 
235 aa  81.3  2e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  28.25 
 
 
239 aa  79  7e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  26.19 
 
 
226 aa  79  8e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  1.32368e-06  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  31.55 
 
 
261 aa  73.9  3e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  72  8e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  28.24 
 
 
255 aa  71.6  1e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  29.81 
 
 
281 aa  70.5  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
295 aa  69.7  4e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  27.46 
 
 
247 aa  70.1  4e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  8.09595e-07  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  27.06 
 
 
226 aa  69.7  4e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  26.13 
 
 
210 aa  65.9  6e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  1.9093e-05  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  30.27 
 
 
225 aa  65.1  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  28.86 
 
 
255 aa  65.1  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  36.45 
 
 
261 aa  65.1  1e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  32.48 
 
 
281 aa  63.9  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  2.08542e-09 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  24.81 
 
 
227 aa  59.7  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0797  hypothetical protein  34.72 
 
 
254 aa  60.1  4e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.530617  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  25.12 
 
 
212 aa  58.9  7e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3834  hypothetical protein  31.52 
 
 
265 aa  57.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  30.51 
 
 
252 aa  55.5  8e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  27.8 
 
 
260 aa  55.5  9e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3884  hypothetical protein  30.98 
 
 
265 aa  55.1  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  30.43 
 
 
236 aa  54.3  2e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  29.71 
 
 
259 aa  53.1  4e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  30.2 
 
 
256 aa  52.4  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
241 aa  52.4  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0800  protein of unknown function DUF820  27.13 
 
 
238 aa  50.8  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  31.65 
 
 
252 aa  50.4  3e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  32.39 
 
 
248 aa  49.7  4e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  26.69 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  25.27 
 
 
266 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  28.74 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  38.1 
 
 
153 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  34.78 
 
 
187 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.58134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  29.37 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  24.21 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  1.33784e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  29.95 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  46.67 
 
 
195 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  40.38 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  32.91 
 
 
190 aa  42.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>