More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1006 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  76.45 
 
 		 259 aa  407  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  65.38 
 
 		 257 aa  348  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  48.03 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  30.31 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.05 
 
 		 115 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  49.56 
 
 		 120 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  50.96 
 
 		 105 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50.47 
 
 		 108 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  54 
 
 		 125 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  51.4 
 
 		 108 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  53 
 
 		 107 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  53 
 
 		 107 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  54 
 
 		 124 aa  125  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  52 
 
 		 148 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  48.15 
 
 		 112 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  52.88 
 
 		 110 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.63 
 
 		 109 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  52.88 
 
 		 110 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  48.57 
 
 		 107 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  52.53 
 
 		 106 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  51.92 
 
 		 110 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  50.96 
 
 		 110 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  51.96 
 
 		 106 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  50.98 
 
 		 109 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  49.52 
 
 		 106 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  57 
 
 		 106 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  49.52 
 
 		 107 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  52.43 
 
 		 108 aa  122  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  54.55 
 
 		 114 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  45.05 
 
 		 114 aa  121  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  58.51 
 
 		 150 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  51 
 
 		 105 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  48.48 
 
 		 109 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  46.67 
 
 		 107 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52.83 
 
 		 107 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  51.49 
 
 		 109 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  47.62 
 
 		 107 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  49 
 
 		 113 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  51.96 
 
 		 109 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  51 
 
 		 109 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  51.02 
 
 		 107 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  46.67 
 
 		 123 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  50.49 
 
 		 109 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  45.54 
 
 		 109 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  46.46 
 
 		 109 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  47.52 
 
 		 109 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  49 
 
 		 108 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  44.04 
 
 		 109 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  50.48 
 
 		 106 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  48.45 
 
 		 107 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  46.15 
 
 		 109 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  48 
 
 		 108 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  48.45 
 
 		 110 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  49.02 
 
 		 108 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  49.04 
 
 		 107 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.96 
 
 		 108 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  50.94 
 
 		 110 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  57.3 
 
 		 109 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  48.57 
 
 		 112 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  56.82 
 
 		 110 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  56.18 
 
 		 109 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  56.18 
 
 		 109 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  47.47 
 
 		 107 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  53.93 
 
 		 110 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  49.51 
 
 		 108 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  48.04 
 
 		 110 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  49.02 
 
 		 108 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  50.55 
 
 		 110 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  48.57 
 
 		 110 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  49.51 
 
 		 109 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  46.53 
 
 		 106 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  48.45 
 
 		 106 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  51.65 
 
 		 107 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  49.48 
 
 		 106 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>