More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1000 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  100 
 
 		 182 aa  359  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  70.88 
 
 		 182 aa  265  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  35.84 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  33.14 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  34.12 
 
 		 199 aa  87.8  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  36.42 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  35.67 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  28.99 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  29.26 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  31.93 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  34.78 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  38.85 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.85 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  37.68 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30.43 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  37.68 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  25.38 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  30.99 
 
 		 531 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  38.36 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  26.35 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  29.92 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  37.08 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  29.94 
 
 		 344 aa  60.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  28.26 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  27.7 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.31 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  40.45 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  26.03 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  28.57 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  28.45 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  28.45 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.61 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  28.93 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  30.67 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  28.45 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  31.25 
 
 		 907 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  38.41 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  25.9 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  28.57 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  26.67 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  27.03 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  27.03 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  26.76 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  27.12 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  32.17 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  35.16 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25.64 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  24.81 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  25.95 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  28.17 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  29.01 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  25.87 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  28.93 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  25.55 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  25.55 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  26.89 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  26.92 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  26.92 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  26.92 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  28.93 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  25.68 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  28.79 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  28.26 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  29.2 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.73 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  26.97 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  26.39 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  27.73 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  23.91 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  31.9 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  23.53 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  26.39 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  27.43 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  22.22 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  29.71 
 
 		 166 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  22.83 
 
 		 162 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  23.91 
 
 		 163 aa  51.6  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  24.81 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  27.54 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  22.86 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  31.25 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  23.91 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  25.37 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  25 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0149  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.49 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  25.17 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.39 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.53 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30.17 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  24.81 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  24.35 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  24.14 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  23.53 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  27.54 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  23.53 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  24.35 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  23.53 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  25.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.26 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>