218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0980 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  90.86 
 
 
197 aa  361  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  83.76 
 
 
197 aa  342  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  78.68 
 
 
197 aa  323  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  58.6 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  54.64 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  39.43 
 
 
187 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  37.43 
 
 
188 aa  124  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  42.22 
 
 
203 aa  122  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  41.85 
 
 
207 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  39.59 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  36.78 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  43.53 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  40.76 
 
 
207 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  37.29 
 
 
185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  45.77 
 
 
203 aa  115  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  35.96 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  42.06 
 
 
180 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  45.39 
 
 
218 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  40.29 
 
 
182 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  41.18 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  34.64 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  35.42 
 
 
191 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  38.67 
 
 
257 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  37.58 
 
 
189 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  35.54 
 
 
190 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  40.62 
 
 
207 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  38.26 
 
 
253 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  37.36 
 
 
197 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  42.11 
 
 
191 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  32.4 
 
 
202 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  37.24 
 
 
200 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  40.3 
 
 
202 aa  99  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.96 
 
 
181 aa  97.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  31.05 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  34.83 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  31.94 
 
 
193 aa  95.9  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  36.47 
 
 
200 aa  95.5  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  31.67 
 
 
218 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  41.61 
 
 
227 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  41.61 
 
 
195 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  35 
 
 
204 aa  95.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  29.44 
 
 
187 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  33.51 
 
 
251 aa  92.8  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  34.81 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  37.41 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  35.38 
 
 
199 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  31.45 
 
 
190 aa  91.7  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 
184 aa  91.3  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  31.89 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  34 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  33.51 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  31.89 
 
 
245 aa  89  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  40.71 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  34.25 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  29.51 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  30.73 
 
 
191 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  32.97 
 
 
187 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  35.76 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  32.6 
 
 
205 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  38.31 
 
 
186 aa  84.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  30.29 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  32.22 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  34.46 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  35.58 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  28.88 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  29.79 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  31.67 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  35.76 
 
 
241 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  35.11 
 
 
244 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  36.41 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  33.9 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  33.87 
 
 
214 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4511  protein of unknown function DUF820  36.41 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  33.93 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  31.58 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  32.97 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  28.73 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  31.46 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  32.52 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  28.19 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  30.14 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  37.91 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  31.07 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  30.18 
 
 
188 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  31.01 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  29.88 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  28.4 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  32.52 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  34.81 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3647  protein of unknown function DUF820  35.71 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0632204  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  33.89 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  33.89 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  34.44 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  32.04 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  44 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>