More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0950 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  100 
 
 
404 aa  776    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  86.88 
 
 
404 aa  588  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  66 
 
 
405 aa  508  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  54.02 
 
 
405 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  46.19 
 
 
401 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  45.96 
 
 
400 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  44.84 
 
 
419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  48.23 
 
 
414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  50 
 
 
396 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  47.16 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  42.33 
 
 
402 aa  263  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  41.56 
 
 
408 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  41.3 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  41.79 
 
 
418 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  40.73 
 
 
413 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  40.78 
 
 
429 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  35.84 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  37.26 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  36.76 
 
 
413 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  36.79 
 
 
414 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  31.38 
 
 
423 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  31.04 
 
 
426 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.98 
 
 
440 aa  166  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  28.53 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  32.9 
 
 
422 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  29.4 
 
 
427 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.83 
 
 
421 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  30.25 
 
 
422 aa  155  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  29.03 
 
 
411 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  29.72 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  29.77 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  28.32 
 
 
427 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  31.05 
 
 
417 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  28.99 
 
 
424 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  30.83 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  30.41 
 
 
431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  32 
 
 
413 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  31 
 
 
415 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  28.57 
 
 
431 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  32.99 
 
 
414 aa  143  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  28.97 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.59 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  29.48 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  29.48 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  28.5 
 
 
437 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  28.74 
 
 
441 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  32.58 
 
 
422 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.25 
 
 
451 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  28.81 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  30.15 
 
 
397 aa  136  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  29.43 
 
 
440 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  29.93 
 
 
444 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  30.46 
 
 
427 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  29.48 
 
 
441 aa  136  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  30.23 
 
 
417 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  29.71 
 
 
441 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  28.57 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  28.57 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  28.57 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  28.57 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  27.86 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  27.86 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  29.48 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  29.53 
 
 
428 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  28.81 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  29.35 
 
 
441 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  28.61 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  28.23 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  30.71 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  29.93 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  28.76 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  29.93 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  29.93 
 
 
444 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  29.93 
 
 
444 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  29.93 
 
 
444 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  29.93 
 
 
444 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.32 
 
 
429 aa  131  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  28.89 
 
 
451 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  32.46 
 
 
417 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  28.1 
 
 
427 aa  129  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.82 
 
 
428 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  28.41 
 
 
440 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  26.83 
 
 
428 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  29.46 
 
 
431 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.43 
 
 
425 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  29.85 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  30.83 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  27.03 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  28.47 
 
 
465 aa  120  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  25.19 
 
 
429 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  28.31 
 
 
577 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  27.05 
 
 
425 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  27.86 
 
 
421 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  28.83 
 
 
446 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  25.91 
 
 
424 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  28.69 
 
 
433 aa  106  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  24.05 
 
 
436 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  25.54 
 
 
444 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  25.54 
 
 
444 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  29.38 
 
 
404 aa  103  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>