More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0913 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  276  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  91.3 
 
 		 138 aa  256  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  50.36 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  39.86 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  38.19 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  39.13 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  40.58 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  39.86 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  37.67 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.26 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  35.29 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.71 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  38.36 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  37.25 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  32.89 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.69 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  36.17 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  35.42 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  36.17 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  40 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.1 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  35.51 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  38.19 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  33.76 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.46 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.05 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.62 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.62 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  33.8 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.5 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.88 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.04 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  33.56 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  34.51 
 
 		 289 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  30.94 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.54 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  35.58 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  38.85 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.19 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  37.25 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.04 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.04 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.19 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.19 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  36.11 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  34.97 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.37 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  35.57 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.51 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.93 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  34.42 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.39 
 
 		 288 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  34.67 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  34.67 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.69 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.62 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  33.55 
 
 		 307 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  35.81 
 
 		 295 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>