16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0897 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0897  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  141  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3531  hypothetical protein  51.56 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0245  hypothetical protein  49.25 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3744  hypothetical protein  50.77 
 
 
85 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0168  hypothetical protein  46.27 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.304804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4371  hypothetical protein  46.27 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146529  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3861  hypothetical protein  48.44 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.565435  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2519  hypothetical protein  43.28 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1941  hypothetical protein  41.54 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.40574  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1955  hypothetical protein  41.54 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1443  hypothetical protein  35.29 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3810  hypothetical protein  46.88 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0173  hypothetical protein  45.28 
 
 
65 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3372  hypothetical protein  39.06 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  0.953606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1740  hypothetical protein  42.19 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2524  hypothetical protein  46.88 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>