22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0890 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0890    100 
 
 		 159 bp  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    92.59 
 
 		 827 bp  151  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  92.52 
 
 		 826 bp  149  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  91.59 
 
 		 826 bp  141  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    91.59 
 
 		 1955 bp  141  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    90.74 
 
 		 876 bp  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    90.74 
 
 		 808 bp  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  90.65 
 
 		 826 bp  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  90.65 
 
 		 826 bp  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  90.65 
 
 		 826 bp  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  91.75 
 
 		 826 bp  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  91 
 
 		 814 bp  127  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  89.72 
 
 		 826 bp  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  89.72 
 
 		 825 bp  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  89.72 
 
 		 826 bp  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    88.79 
 
 		 825 bp  117  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    91.25 
 
 		 818 bp  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    91.55 
 
 		 348 bp  93.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    86 
 
 		 366 bp  87.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    86 
 
 		 807 bp  87.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    83.91 
 
 		 823 bp  54  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  96.55 
 
 		 942 bp  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>