21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0888 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  81.98 
 
 		 227 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  54.71 
 
 		 235 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  54.95 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  54.22 
 
 		 228 aa  241  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  53.78 
 
 		 228 aa  241  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  53.78 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  52.91 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  53.33 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  54.26 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  51.8 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  51.79 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  53.57 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  51.34 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  48.43 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  48.88 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  48.66 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  48.66 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  48.66 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  45.12 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  39.91 
 
 		 190 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>