More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0879 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  81.88 
 
 		 284 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  64.48 
 
 		 273 aa  349  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  65.1 
 
 		 310 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 		 279 aa  224  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  43.23 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  42.08 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 405 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.04 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.83 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 352 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  29.89 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.05 
 
 		 372 aa  92  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.48 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.7 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.06 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.44 
 
 		 368 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.1 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.38 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 300 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.41 
 
 		 368 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 226 aa  85.9  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  38.26 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.39 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  27.6 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.06 
 
 		 370 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.08 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  38.26 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  26.57 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.58 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  28.92 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.02 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  24.38 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.03 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.42 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  23.4 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  29.71 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.03 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  24.03 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  27.51 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>