More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0875 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  95.9 
 
 
561 aa  1098    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  71.66 
 
 
557 aa  847    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  62.37 
 
 
569 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
561 aa  1138    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  53.05 
 
 
553 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  50.54 
 
 
560 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  50.97 
 
 
554 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  48.75 
 
 
555 aa  571  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  48.39 
 
 
555 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  49.29 
 
 
555 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
554 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  48.84 
 
 
555 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  49.91 
 
 
566 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  49.29 
 
 
558 aa  555  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  46.35 
 
 
548 aa  552  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  48.13 
 
 
555 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  47.24 
 
 
551 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 
551 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  47.42 
 
 
551 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  47.51 
 
 
553 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  47.76 
 
 
554 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  48.12 
 
 
551 aa  545  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  47.86 
 
 
555 aa  542  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  48.58 
 
 
559 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  47.77 
 
 
553 aa  541  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  47.31 
 
 
554 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  46.7 
 
 
618 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  44.72 
 
 
560 aa  526  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  48.2 
 
 
558 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  43.39 
 
 
557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  43.39 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.39 
 
 
557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  43.04 
 
 
557 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.04 
 
 
557 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  43.21 
 
 
557 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.21 
 
 
557 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.86 
 
 
557 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  41.39 
 
 
557 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  43.62 
 
 
555 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
556 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  45.86 
 
 
558 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  43.17 
 
 
556 aa  498  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  43.19 
 
 
583 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  43.17 
 
 
556 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  44.4 
 
 
555 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  46.4 
 
 
569 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  42.99 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  43.86 
 
 
555 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  45.04 
 
 
556 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  43.68 
 
 
555 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  42.99 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  43.68 
 
 
555 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  42.99 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  43.68 
 
 
555 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  42.99 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  43.68 
 
 
555 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  42.99 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  42.99 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  43.68 
 
 
555 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  42.55 
 
 
555 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  43.68 
 
 
555 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  42.73 
 
 
555 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  42.99 
 
 
556 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  43.68 
 
 
555 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  42.55 
 
 
555 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  45.5 
 
 
558 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  45.32 
 
 
558 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 
593 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  44.32 
 
 
564 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  42.75 
 
 
565 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  42.75 
 
 
565 aa  488  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  42.17 
 
 
560 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  42.01 
 
 
555 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  45.69 
 
 
533 aa  482  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  43.91 
 
 
552 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  42.5 
 
 
561 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  43.01 
 
 
556 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  45.5 
 
 
561 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  43.85 
 
 
561 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  45.5 
 
 
561 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  39.82 
 
 
559 aa  463  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  41.4 
 
 
556 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.06 
 
 
555 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  43.17 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  41.41 
 
 
560 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  40.71 
 
 
591 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  43.17 
 
 
561 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  44.68 
 
 
561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  43.39 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  43.71 
 
 
561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 
561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.26 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  43.42 
 
 
561 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.17 
 
 
559 aa  450  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  43.21 
 
 
561 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  40.36 
 
 
560 aa  449  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 
561 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  44.17 
 
 
565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  41.7 
 
 
573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.78 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>