More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0855 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
359 aa  728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  83.84 
 
 
359 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  65.44 
 
 
357 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  53.65 
 
 
624 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  53.09 
 
 
679 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  49.3 
 
 
374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  49.16 
 
 
377 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  48.99 
 
 
616 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  31.25 
 
 
1219 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.88 
 
 
1644 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
3301 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.88 
 
 
1644 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
856 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
725 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
545 aa  99.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
791 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
1233 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  27.31 
 
 
1232 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  28.94 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  30.51 
 
 
1635 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
1386 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  32.69 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
671 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  28.79 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
404 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  28.26 
 
 
759 aa  85.9  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
774 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
873 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  24.38 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
867 aa  77  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  31.11 
 
 
787 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  29.24 
 
 
916 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
3145 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
820 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
816 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
1044 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1447  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000198609 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 
995 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
827 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
623 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
392 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.49 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
416 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  25.55 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
819 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.62 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
803 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
871 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
389 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
378 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
452 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
379 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1523  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
626 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
344 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.83 
 
 
2401 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
391 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
402 aa  63.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3834  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
352 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734924 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
428 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
425 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
392 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  30.11 
 
 
361 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
380 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.73 
 
 
769 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  29.91 
 
 
420 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3749  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
352 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
812 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  25.14 
 
 
400 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
364 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
416 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
384 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
743 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1293  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>