189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0830 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  329  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  86.92 
 
 
292 aa  232  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  70.31 
 
 
285 aa  181  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  68.75 
 
 
285 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  68.75 
 
 
285 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  68.75 
 
 
285 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  68.46 
 
 
283 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  67.69 
 
 
283 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  58.46 
 
 
277 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  56.35 
 
 
309 aa  140  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  55.65 
 
 
281 aa  127  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  50 
 
 
257 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  44.19 
 
 
266 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  48.39 
 
 
269 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  47.76 
 
 
267 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  45.24 
 
 
255 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  42.74 
 
 
283 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  43.31 
 
 
267 aa  84  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  43.65 
 
 
264 aa  84  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  45.67 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  42.06 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  44.44 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  42.06 
 
 
255 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  44.88 
 
 
255 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  44.63 
 
 
255 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  44.88 
 
 
255 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  44.88 
 
 
255 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
255 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  40.8 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  41.46 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  40.94 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  42.65 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  35.43 
 
 
273 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  39.69 
 
 
272 aa  70.5  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  35.43 
 
 
273 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  35.43 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  35.71 
 
 
280 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  37.88 
 
 
294 aa  65.1  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  30.99 
 
 
272 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  30.99 
 
 
272 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  42.86 
 
 
364 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  34.34 
 
 
271 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  37.5 
 
 
248 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  38.82 
 
 
190 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  34.02 
 
 
292 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  37.35 
 
 
190 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  31.47 
 
 
272 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  32.17 
 
 
275 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
272 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  34.38 
 
 
278 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  31.47 
 
 
272 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  38.1 
 
 
276 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  38.27 
 
 
389 aa  54.3  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  30.99 
 
 
272 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  32.28 
 
 
262 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
265 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  29.37 
 
 
272 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
249 aa  50.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
277 aa  50.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  37.21 
 
 
279 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  39.56 
 
 
294 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.94 
 
 
266 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  29.58 
 
 
272 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.3 
 
 
252 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.78 
 
 
265 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.7 
 
 
249 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  37.33 
 
 
552 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  28.37 
 
 
272 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  39.08 
 
 
257 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
247 aa  48.5  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
244 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
248 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  34.52 
 
 
270 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  34.52 
 
 
270 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
189 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  47.46 
 
 
198 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  40.48 
 
 
283 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
274 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.8 
 
 
190 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  28.83 
 
 
268 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  34.57 
 
 
389 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
270 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  34.57 
 
 
389 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.21 
 
 
237 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.54 
 
 
222 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
253 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  37.5 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
287 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.51 
 
 
232 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
256 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
198 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  35.53 
 
 
408 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  40 
 
 
311 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.17 
 
 
247 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  33.82 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
295 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
284 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32.22 
 
 
436 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>