More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0805 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  100 
 
 
229 aa  447  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  90.83 
 
 
229 aa  415  1e-115  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.38 
 
 
234 aa  313  1e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.82 
 
 
235 aa  232  4e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 
230 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 
229 aa  220  1e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 
231 aa  214  1e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 
237 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  49.56 
 
 
297 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 
236 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  52.44 
 
 
232 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
231 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  45.58 
 
 
227 aa  204  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 
232 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  51.11 
 
 
244 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  51.11 
 
 
244 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 
238 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 
235 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  46.49 
 
 
234 aa  200  1e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 
239 aa  200  1e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 
238 aa  200  1e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 
234 aa  200  1e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
227 aa  200  1e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
251 aa  200  2e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 
229 aa  200  2e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 
232 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 
230 aa  199  4e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  4.66515e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  45.45 
 
 
241 aa  198  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 
225 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  44.59 
 
 
241 aa  198  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 
241 aa  198  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 
230 aa  198  8e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.77207e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 
246 aa  197  8e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
265 aa  197  1e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
236 aa  197  1e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  1.82155e-08 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 
230 aa  197  1e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
265 aa  197  1e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
236 aa  197  1e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  46.12 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 
223 aa  196  2e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
251 aa  196  2e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
251 aa  196  2e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  46.7 
 
 
229 aa  196  2e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.27834e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 
238 aa  196  2e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.7 
 
 
229 aa  197  2e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 
234 aa  196  2e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 
231 aa  197  2e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  46.35 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  46.35 
 
 
239 aa  196  2e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 
239 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
240 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 
239 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  47.98 
 
 
233 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 
239 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.69 
 
 
239 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  45.69 
 
 
239 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 
239 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  45.89 
 
 
236 aa  195  5e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
248 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 
228 aa  195  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 
232 aa  194  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 
225 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 
229 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
224 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
229 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.43261e-07  hitchhiker  6.15281e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.7 
 
 
229 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.20801e-07  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
229 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 
231 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  4.30064e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
229 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.91119e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
229 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.28627e-07  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
229 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.07229e-06  decreased coverage  2.63688e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  46.7 
 
 
239 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
229 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.57343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
227 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
226 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 
234 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 
229 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 
229 aa  191  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  4.60678e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
236 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
246 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
246 aa  191  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 
225 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
224 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  48.02 
 
 
236 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
230 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  4.63151e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 
225 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.49 
 
 
239 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.11905e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 
241 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  5.93879e-06  unclonable  3.30773e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 
229 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  8.55765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 
231 aa  189  3e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 
229 aa  189  3e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01285e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 
229 aa  189  3e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 
229 aa  189  3e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  7.02519e-08  hitchhiker  1.06408e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 
232 aa  189  3e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 
221 aa  189  3e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 
231 aa  189  3e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.73 
 
 
235 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 
228 aa  189  3e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
238 aa  189  3e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>