More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0761 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  96.94 
 
 		 229 aa  453  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.62 
 
 		 227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 		 247 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  48.65 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  47.32 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.3 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.09 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  47.3 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  45.85 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  47.3 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  47.3 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  47.3 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  47.3 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  47.3 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  47.3 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  47.3 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  43.95 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 232 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  45.95 
 
 		 234 aa  191  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  43.5 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.33 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  42.27 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  40.89 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  41.96 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  40.09 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>