More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0734 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009974  Haur_5277  N-6 DNA methylase  61.96 
 
 		 571 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0734  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 534 aa  1093    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303269  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2087  N-6 DNA methylase  50.84 
 
 		 509 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122296 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  38.83 
 
 		 492 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1724  type I restriction-modification system, M subunit  37.92 
 
 		 494 aa  342  9e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  37.12 
 
 		 710 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  34.78 
 
 		 503 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  38.43 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  34.68 
 
 		 486 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1577  type I restriction-modification system, M subunit  35.27 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0228  N-6 DNA methylase  35.07 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2651  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.72 
 
 		 484 aa  276  8e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0553747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  36.31 
 
 		 490 aa  276  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.45 
 
 		 703 aa  276  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0807  DNA-methyltransferase, type I restriction-modification enzyme subunit M  34.22 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.444408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  38.09 
 
 		 481 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  35.33 
 
 		 500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  33.97 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  34.95 
 
 		 489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  34.97 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.88 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1634  N-6 DNA methylase  32.89 
 
 		 495 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  33.14 
 
 		 484 aa  260  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  33.46 
 
 		 493 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  33.91 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  35.14 
 
 		 492 aa  252  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  33.72 
 
 		 488 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  35.14 
 
 		 489 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  31.78 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  34.41 
 
 		 489 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  35.91 
 
 		 489 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  35.91 
 
 		 489 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  35.15 
 
 		 481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  35.05 
 
 		 493 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  34.82 
 
 		 490 aa  243  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  34.04 
 
 		 481 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  34.15 
 
 		 488 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  34.54 
 
 		 489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  33.65 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  33.71 
 
 		 489 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  34.99 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  34.03 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  31.35 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  34.64 
 
 		 485 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20220  N-6 DNA methylase  31.51 
 
 		 484 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.644983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1026  N-6 DNA methylase  28.67 
 
 		 549 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  27.58 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04215  DNA methylase M  31.8 
 
 		 529 aa  170  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04181  hypothetical protein  31.8 
 
 		 529 aa  170  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4931  type I restriction enzyme EcoKI M protein  31.33 
 
 		 529 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  30.46 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  32.3 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0841  type I restriction-modification system, M subunit  28.97 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  29.75 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1525  type I restriction modification enzyme methylase subunit  28.06 
 
 		 579 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  28.94 
 
 		 570 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  27.01 
 
 		 553 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  27.37 
 
 		 545 aa  160  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1671  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.16 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  28.1 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1673  N-6 DNA methylase  29.36 
 
 		 493 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  28.8 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  28.41 
 
 		 484 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  26.49 
 
 		 544 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  26.01 
 
 		 544 aa  156  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  28.17 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.48 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  26.3 
 
 		 553 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  28.41 
 
 		 539 aa  153  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  27 
 
 		 506 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  36.25 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4188  N-6 DNA methylase  26.91 
 
 		 540 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  30.07 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1501  N-6 DNA methylase  30.69 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2418  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0240611  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  31.38 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  37.07 
 
 		 846 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03611  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.73 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  37.6 
 
 		 834 aa  148  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  25.26 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  30.5 
 
 		 808 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  26.7 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3772  N-6 DNA methylase  36.4 
 
 		 429 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  25.61 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3845  N-6 DNA methylase  36.4 
 
 		 429 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  28.74 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  29.22 
 
 		 481 aa  143  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3011  N-6 DNA methylase  31.34 
 
 		 563 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.467528  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.44 
 
 		 533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  33.82 
 
 		 775 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  30.32 
 
 		 1005 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  35.25 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3517  N-6 DNA methylase  30.66 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02064  type I restriction enzyme EcoKI M protein  26.97 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3181  N-6 DNA methylase  30.96 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1096  N-6 DNA methylase  29.77 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.68 
 
 		 816 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 		 513 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>