More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0725 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 556 aa  1104    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  81.29 
 
 		 556 aa  921    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  47.12 
 
 		 554 aa  475  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4683  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 564 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.71 
 
 		 546 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 538 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  31.28 
 
 		 534 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 		 576 aa  200  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 565 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  32.91 
 
 		 540 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 539 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.26 
 
 		 538 aa  193  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 551 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  31.89 
 
 		 563 aa  188  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 595 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 586 aa  170  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 		 554 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 559 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.63 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.37 
 
 		 511 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 555 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.79 
 
 		 511 aa  157  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 		 526 aa  156  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.79 
 
 		 511 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 		 619 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  26.44 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  26.44 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.44 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.44 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  26.44 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.44 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.44 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.44 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 535 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.27 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4018  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.78 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.04 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  27.78 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  27.78 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 535 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 531 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  31.01 
 
 		 524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  26.79 
 
 		 518 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.48 
 
 		 511 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 		 531 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 530 aa  140  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  28.6 
 
 		 605 aa  140  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.04 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.04 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.04 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.81 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  28.37 
 
 		 596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 549 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.81 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 533 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 535 aa  136  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  29.28 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 521 aa  134  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.29 
 
 		 594 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.87 
 
 		 562 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.45 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.3 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 536 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 605 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 604 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 593 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.09 
 
 		 567 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 544 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 544 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 531 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.2 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 567 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.76 
 
 		 510 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  31.17 
 
 		 524 aa  126  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 557 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>