107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0645 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
315 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  63.11 
 
 
324 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  58.44 
 
 
337 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  57.61 
 
 
320 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.05 
 
 
316 aa  347  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  48.56 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  47.4 
 
 
303 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  41.64 
 
 
313 aa  256  4e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  42.11 
 
 
323 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.37 
 
 
322 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  43.61 
 
 
318 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.67 
 
 
330 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  42.62 
 
 
314 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  42.48 
 
 
342 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.79 
 
 
303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.65 
 
 
304 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  41.67 
 
 
315 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  43.53 
 
 
307 aa  228  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.96 
 
 
309 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  41.29 
 
 
327 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  40.45 
 
 
303 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.75 
 
 
306 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  41.57 
 
 
305 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.18 
 
 
305 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.46 
 
 
307 aa  225  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  41.27 
 
 
324 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  38.75 
 
 
306 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  38.41 
 
 
307 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.18 
 
 
305 aa  225  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  38.41 
 
 
306 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  38.41 
 
 
306 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  40.08 
 
 
305 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  42.11 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.33 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.76 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  41.18 
 
 
305 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.15 
 
 
306 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.85 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.98 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  42.05 
 
 
327 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  40.78 
 
 
305 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.31 
 
 
299 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.07 
 
 
306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.66 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.46 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  38.95 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  40.08 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.3 
 
 
305 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.24 
 
 
313 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  41.11 
 
 
314 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  36.77 
 
 
328 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.85 
 
 
255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.65 
 
 
277 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  38.58 
 
 
291 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  41.2 
 
 
319 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  40 
 
 
291 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  39.3 
 
 
291 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.59 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.59 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.51 
 
 
332 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  35.21 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  36.15 
 
 
294 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  35.38 
 
 
294 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.92 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.92 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  31.02 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  35.96 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.53 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  30.4 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  23.59 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  23.57 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  24.41 
 
 
333 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  37.66 
 
 
130 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  24.16 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  23.29 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.5 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  22.95 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.48 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  22.82 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  24.9 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  24.9 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.48 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  23.88 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  23.88 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  23 
 
 
334 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.9 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.9 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  24.23 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  23.15 
 
 
545 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  21.48 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  21.48 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.48 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.35 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  22.71 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.79 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.07 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  29.46 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.16 
 
 
330 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  20.83 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  25.83 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>