More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0593 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  85.71 
 
 		 158 aa  283  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  34.04 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  29.17 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  33.1 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4545  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  28.99 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.57 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  32.61 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  32.64 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  30.23 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  30.43 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  37.98 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  30.07 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  25.35 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  28.19 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  30.14 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  31.34 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  31.34 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  28.57 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.12 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  30.83 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  27.89 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  26.43 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  27.21 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  26.56 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  29.85 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  29.85 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  29.25 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  29.25 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  27.94 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  30.37 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  30.37 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  32.81 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  30.28 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  25.17 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  25.17 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  30.3 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  31.17 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  31.11 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  27.7 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  30.83 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  30.89 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  24.43 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  28.24 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  30.61 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  32.59 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  27.54 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  26.81 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  23.66 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  23.66 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  23.66 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  23.66 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0184  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.567959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  28.87 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  23.66 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  23.66 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  23.66 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  27.54 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  23.66 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  27.82 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  29.55 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  28.69 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  24.06 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>