More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0563 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
243 aa  481  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  79.75 
 
 
244 aa  381  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  67.08 
 
 
247 aa  325  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 
283 aa  232  4e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 
541 aa  229  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.16 
 
 
278 aa  230  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
403 aa  228  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 
281 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.16 
 
 
278 aa  225  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  46.15 
 
 
398 aa  223  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 
281 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
411 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  47.86 
 
 
284 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
395 aa  222  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.53 
 
 
285 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.98 
 
 
402 aa  219  4e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
276 aa  218  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.88 
 
 
285 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
288 aa  218  8e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 
285 aa  218  9e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 
281 aa  213  2e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
284 aa  209  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.76304e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
453 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
277 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.54 
 
 
281 aa  208  7e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.63 
 
 
274 aa  208  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 
440 aa  207  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  2.92327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.69 
 
 
277 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 
274 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
310 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.92 
 
 
284 aa  205  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  43.39 
 
 
380 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  43.75 
 
 
263 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.92 
 
 
285 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
456 aa  201  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.55 
 
 
277 aa  200  1e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  47.09 
 
 
291 aa  201  1e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
249 aa  198  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.21 
 
 
403 aa  198  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
286 aa  196  2e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.88 
 
 
283 aa  196  2e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.64 
 
 
252 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
266 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.61 
 
 
305 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.62 
 
 
252 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 
259 aa  191  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.05 
 
 
276 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 
259 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  41.45 
 
 
280 aa  189  3e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.72949e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  35.5 
 
 
283 aa  189  3e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.27 
 
 
270 aa  188  6e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  40 
 
 
284 aa  188  6e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 
257 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 
243 aa  183  2e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.16 
 
 
273 aa  183  2e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.82859e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.12 
 
 
271 aa  181  8e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  47.47 
 
 
271 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.86 
 
 
279 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 
253 aa  179  5e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2189  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.41 
 
 
271 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  39.57 
 
 
282 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 
271 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2242  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 
271 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  normal  0.066673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2142  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 
271 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2355  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 
271 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.142366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2196  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 
271 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 
255 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  43.35 
 
 
242 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
286 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.82138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  42.53 
 
 
273 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 
250 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
244 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  38.4 
 
 
280 aa  174  1e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 
270 aa  174  1e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 
254 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 
246 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  36.8 
 
 
237 aa  172  6e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  43.97 
 
 
246 aa  171  7e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  45.83 
 
 
277 aa  171  8e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  44.5 
 
 
276 aa  171  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  42.29 
 
 
255 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 
252 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 
270 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.02 
 
 
288 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074e-19 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
258 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  42.73 
 
 
255 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  39.91 
 
 
286 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.75654e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
249 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
254 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 
256 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 
290 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 
291 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.52159e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
249 aa  168  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.84786e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  36.48 
 
 
283 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.23426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 
256 aa  168  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  36.82 
 
 
242 aa  168  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  36.48 
 
 
283 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 
293 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.62 
 
 
293 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  42.13 
 
 
269 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>