127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0548 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  56.25 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  47.32 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  44.95 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  45.79 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  36.84 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  42.98 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  42.42 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  43.36 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  43.36 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  43.75 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1947  protein of unknown function DUF86  49.49 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1958  protein of unknown function DUF86  49.49 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  40.38 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  41.51 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  43.56 
 
 		 117 aa  97.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3032  hypothetical protein  39.45 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.488274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  38.18 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  39.09 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  37.27 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  43.56 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  43.14 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  44.44 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  40.4 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0685  hypothetical protein  41.58 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  42.72 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  40.59 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1293  protein of unknown function DUF86  34.23 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.053291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  34.91 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3136  protein of unknown function DUF86  37.25 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.29369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3537  hypothetical protein  39.42 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2973  protein of unknown function DUF86  37.62 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  36.04 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3906  protein of unknown function DUF86  37.17 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  37.37 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  36.7 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  39.22 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2494  hypothetical protein  35.05 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2482  hypothetical protein  37.04 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3483  protein of unknown function DUF86  40.2 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  36.84 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  34.91 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  34.91 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  49.23 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  34.82 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3141  protein of unknown function DUF86  36.46 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2968  protein of unknown function DUF86  36.46 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1653  hypothetical protein  36.75 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1474  protein of unknown function DUF86  37.89 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.173165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  36.04 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  43.9 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  44.68 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  32 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  32 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  39 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2071  protein of unknown function DUF86  39.81 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1083  protein of unknown function DUF86  40.28 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50240  hypothetical protein  38.14 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.753692  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  34.31 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  32.98 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  31.25 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0846  hypothetical protein  36.94 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1112  hypothetical protein  36.89 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0480  hypothetical protein  37.36 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2367  hypothetical protein  36.04 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.855839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1297  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3298  protein of unknown function DUF86  34.34 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0274  hypothetical protein  34.41 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  31.07 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  31.07 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  33.65 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  33.01 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0316  protein of unknown function DUF86  30.77 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0422358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3145  protein of unknown function DUF86  30.56 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1732  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3940  protein of unknown function DUF86  30 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  37.36 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0203  protein of unknown function DUF86  32.29 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  30.84 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2423  hypothetical protein  30.91 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5351  hypothetical protein  32.11 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.150444  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0872  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0930  protein of unknown function DUF86  36.36 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.922217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0333  protein of unknown function DUF86  34.34 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1407  hypothetical protein  30.61 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0194477  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2149  protein of unknown function DUF86  30.61 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2454  protein of unknown function DUF86  36.67 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.169187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1202  hypothetical protein  30.7 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0520235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0604  hypothetical protein  26.79 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3961  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.626925  normal  0.333719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0375  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1165  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2417  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2671  hypothetical protein  33.63 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.850866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1208  protein of unknown function DUF86  31.9 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0153  hypothetical protein  27.93 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1756  hypothetical protein  28.3 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.489985  normal  0.131681 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>