More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0494 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  92.28 
 
 
610 aa  1100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  100 
 
 
611 aa  1229  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  65.11 
 
 
592 aa  788  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  51.33 
 
 
594 aa  638  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
607 aa  578  1e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
622 aa  574  1e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  46.74 
 
 
635 aa  569  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  45.74 
 
 
600 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  48.82 
 
 
600 aa  548  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
600 aa  541  1e-152  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  46.42 
 
 
623 aa  520  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  42.42 
 
 
588 aa  507  1e-142  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.01252e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  50.17 
 
 
592 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 
608 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  40 
 
 
611 aa  501  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.1667e-08  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  41.15 
 
 
590 aa  493  1e-138  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  43.19 
 
 
602 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  41.79 
 
 
614 aa  490  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  45.8 
 
 
602 aa  492  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  41.03 
 
 
611 aa  485  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  40.37 
 
 
588 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  42.32 
 
 
603 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  40.67 
 
 
613 aa  481  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  40.5 
 
 
603 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  43.38 
 
 
616 aa  475  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  43.57 
 
 
617 aa  470  1e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
586 aa  466  1e-130  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  38.34 
 
 
591 aa  467  1e-130  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  42.49 
 
 
625 aa  467  1e-130  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.47 
 
 
592 aa  465  1e-130  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  46.59 
 
 
650 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  37.52 
 
 
589 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  38.94 
 
 
619 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  43.68 
 
 
614 aa  454  1e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  43.54 
 
 
608 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  39.93 
 
 
597 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  39.09 
 
 
588 aa  440  1e-122  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  38.14 
 
 
586 aa  441  1e-122  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.62 
 
 
587 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  38.62 
 
 
587 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.62 
 
 
587 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06018e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 
587 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.47455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
587 aa  439  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  38.75 
 
 
587 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  38.07 
 
 
587 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  38.41 
 
 
587 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.45 
 
 
587 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.45 
 
 
587 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  37.35 
 
 
587 aa  432  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  38.42 
 
 
599 aa  422  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  38.76 
 
 
587 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  40.5 
 
 
608 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  37.12 
 
 
597 aa  418  1e-115  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  39.5 
 
 
602 aa  419  1e-115  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  37.02 
 
 
637 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  38.91 
 
 
607 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  38.56 
 
 
621 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.73 
 
 
609 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
642 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  36.75 
 
 
584 aa  408  1e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  36.62 
 
 
609 aa  407  1e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.02 
 
 
610 aa  406  1e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.59 
 
 
589 aa  408  1e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  40.34 
 
 
592 aa  407  1e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  35.91 
 
 
594 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.96 
 
 
598 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.02 
 
 
592 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  38.93 
 
 
585 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  41.27 
 
 
675 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  36.24 
 
 
579 aa  400  1e-110  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.84481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  36.24 
 
 
579 aa  400  1e-110  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  36.58 
 
 
594 aa  400  1e-110  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  42.2 
 
 
610 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  42.2 
 
 
610 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.47 
 
 
632 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.88 
 
 
602 aa  395  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  39.69 
 
 
636 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.21 
 
 
594 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  39.81 
 
 
622 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  36.14 
 
 
632 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  41.97 
 
 
629 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  38.49 
 
 
606 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  37.62 
 
 
645 aa  388  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  39.8 
 
 
598 aa  389  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  37.61 
 
 
603 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  2.45046e-06  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  34.51 
 
 
578 aa  385  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34.61 
 
 
598 aa  383  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.07 
 
 
597 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  36.82 
 
 
619 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.71 
 
 
598 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.07 
 
 
597 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  37.11 
 
 
600 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
620 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  38.25 
 
 
585 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  35.64 
 
 
593 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
598 aa  379  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  38.76 
 
 
592 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
592 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.42 
 
 
625 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  36.36 
 
 
632 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>