More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0489 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  77.53 
 
 		 403 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  76.79 
 
 		 403 aa  645    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 405 aa  829    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  94.81 
 
 		 405 aa  795    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  72.03 
 
 		 405 aa  613  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  69.67 
 
 		 403 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  69.92 
 
 		 403 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  68.3 
 
 		 414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  68.78 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  68.53 
 
 		 395 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  67.08 
 
 		 399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  67.68 
 
 		 396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  67.17 
 
 		 395 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  67.18 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 		 399 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  66.92 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  65.15 
 
 		 396 aa  548  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 396 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  66.16 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  63.75 
 
 		 406 aa  536  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 391 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 391 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  65.23 
 
 		 402 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  63 
 
 		 406 aa  534  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  65.25 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  63.25 
 
 		 406 aa  534  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  63.64 
 
 		 395 aa  524  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  63.64 
 
 		 395 aa  524  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  64.19 
 
 		 395 aa  519  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  65.09 
 
 		 398 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  62.06 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  62.06 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  65.16 
 
 		 403 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 		 407 aa  511  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 		 402 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  64.91 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  62.47 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  61.32 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  60.8 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  64.03 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 383 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  67.59 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  64.16 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 		 408 aa  498  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 		 383 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 383 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  61.48 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 		 399 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 		 383 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  61.15 
 
 		 390 aa  491  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  63.22 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  63.64 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  63.41 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 		 383 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  62.81 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 		 383 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  58.92 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  63.91 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  62.78 
 
 		 401 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 		 383 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  62.22 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 		 383 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  60.64 
 
 		 403 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  61.99 
 
 		 389 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 		 384 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  60.9 
 
 		 395 aa  487  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  63.28 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  56.31 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 		 384 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  57.52 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  62.88 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  62.47 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  60.91 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>