21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0486 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  690    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  79.13 
 
 
346 aa  548  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  33.93 
 
 
342 aa  199  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  33.93 
 
 
342 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  32.5 
 
 
343 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  27.17 
 
 
342 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  28.53 
 
 
353 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  24.79 
 
 
355 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  26.7 
 
 
356 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  30.34 
 
 
356 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  30.81 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  26.8 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  26.47 
 
 
346 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  25 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  27.4 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  28.25 
 
 
355 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  25.95 
 
 
341 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  29.39 
 
 
339 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  26.26 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  26.57 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  26.77 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>