104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0464 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  89.66 
 
 
261 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  71.88 
 
 
260 aa  363  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 
278 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  31.62 
 
 
278 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  31.62 
 
 
278 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  31.62 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  31.62 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  31.62 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  31.62 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  31.62 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  31.62 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  31.62 
 
 
278 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  26.46 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  32.09 
 
 
288 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  30.74 
 
 
272 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  30.74 
 
 
272 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  27.76 
 
 
261 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  27.17 
 
 
261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  26.77 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  27.17 
 
 
261 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  26.88 
 
 
261 aa  99  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  31.76 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  26.64 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  26.59 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  26.85 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  31.33 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  25.82 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  23.48 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  30.47 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  25.25 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  24.75 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  24.75 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  24.24 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  24.24 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  24.24 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  24.24 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  22.83 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  23.74 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  24.24 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  24.24 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  28.22 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  23.13 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  28.74 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  34.12 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  33.54 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0992  transcriptional regulator, TrmB  28.99 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  30.86 
 
 
279 aa  58.9  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  23.91 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  28 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  32.16 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  24.46 
 
 
357 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  34.78 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  25.43 
 
 
358 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  24.41 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  26.69 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  27.37 
 
 
267 aa  52  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  36.71 
 
 
119 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  28.57 
 
 
256 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  32.48 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  23.31 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  34.58 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  25.88 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  28.49 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  24.41 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  42.11 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  25.52 
 
 
373 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  26.42 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  37.33 
 
 
268 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  35 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  27.33 
 
 
354 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  46.3 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  24.41 
 
 
223 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  29.25 
 
 
233 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 
250 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  27.86 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  27.38 
 
 
350 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1638  transcriptional regulator, TrmB  31.76 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 
354 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  34.21 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  42.19 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  27.38 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 
352 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4460  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000101535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  34.55 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  24.46 
 
 
363 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>