148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0460 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  36.71 
 
 		 1321 aa  745    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  39.46 
 
 		 1319 aa  807    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  38.65 
 
 		 1338 aa  832    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  40.15 
 
 		 1318 aa  832    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  39.69 
 
 		 1354 aa  896    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1459 aa  751    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  38.26 
 
 		 1331 aa  712    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  41.72 
 
 		 1338 aa  844    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 1373 aa  2737    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  36.94 
 
 		 1322 aa  718    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  45.31 
 
 		 1422 aa  1026    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  45.62 
 
 		 1712 aa  845    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  38.41 
 
 		 1219 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  54.22 
 
 		 1333 aa  1362    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  33.9 
 
 		 1343 aa  694    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  39.94 
 
 		 1322 aa  779    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  44.56 
 
 		 1336 aa  998    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  40 
 
 		 1355 aa  920    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  41.4 
 
 		 1306 aa  907    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  45.29 
 
 		 1339 aa  992    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  47.52 
 
 		 1243 aa  613  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  41.23 
 
 		 1282 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  36.59 
 
 		 1358 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  40.84 
 
 		 1290 aa  556  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  38 
 
 		 1055 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  31.69 
 
 		 1442 aa  269  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1250 aa  257  9e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1250 aa  252  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.56 
 
 		 1432 aa  209  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  22.11 
 
 		 1277 aa  182  4.999999999999999e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  34.82 
 
 		 926 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  20.46 
 
 		 1278 aa  172  5e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1426 aa  161  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1375 aa  151  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1022 aa  150  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1612 aa  149  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1332 aa  144  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0584  hypothetical protein  26.42 
 
 		 826 aa  139  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1098 aa  136  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1349 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1581 aa  127  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1575 aa  124  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1441 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.3 
 
 		 1640 aa  123  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  28.09 
 
 		 1581 aa  119  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1557 aa  118  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1572 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1579 aa  116  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1642 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1644 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1640 aa  115  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1321 aa  115  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1363 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1342 aa  113  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1709 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1339 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1339 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.24 
 
 		 1573 aa  111  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1298 aa  110  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1365 aa  105  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1440 aa  105  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1353 aa  104  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1409 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1546 aa  103  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1461 aa  103  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  34.55 
 
 		 846 aa  102  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1751 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1452 aa  100  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1347 aa  98.2  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1346 aa  96.3  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1366 aa  93.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1347 aa  90.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  21.16 
 
 		 1089 aa  81.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  21.84 
 
 		 1257 aa  80.1  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  21.36 
 
 		 1256 aa  79.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  21.99 
 
 		 1244 aa  79.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  38 
 
 		 1041 aa  79  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  20.7 
 
 		 1252 aa  77.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  31.71 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  21.81 
 
 		 1186 aa  73.2  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1104 aa  70.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1154 aa  68.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.43 
 
 		 1194 aa  68.6  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1299 aa  67.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.1 
 
 		 1058 aa  65.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1088 aa  65.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  23.95 
 
 		 974 aa  63.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1177 aa  62.8  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  27.47 
 
 		 882 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  24.57 
 
 		 1076 aa  60.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1178 aa  60.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1147 aa  59.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  33.94 
 
 		 1170 aa  59.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1209 aa  58.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1210 aa  58.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1120 aa  58.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  37.27 
 
 		 792 aa  57.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  28.07 
 
 		 1132 aa  56.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  22.01 
 
 		 1002 aa  56.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.37 
 
 		 1159 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>