113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0428 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  88.55 
 
 		 132 aa  240  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  66.92 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  47.33 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  43.31 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  41.73 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  40.94 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  39.26 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  41.6 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  44.35 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  36.92 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  36.43 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  37.98 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  36.64 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  34.11 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  35.2 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  36.64 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  36.22 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  33.87 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  31.4 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  36.29 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  32.8 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  40.22 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  43.06 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  32.35 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  41.84 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.62 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  35.35 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  44.05 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  44.05 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  44.05 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  34.41 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  43.94 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.31 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  33.65 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  32.26 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  33.66 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  34.02 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.63 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  37.04 
 
 		 473 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  31.63 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  31.63 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  37.23 
 
 		 322 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  36.17 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  33.94 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  35.09 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  29 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  36.46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5351  protein of unknown function DUF35  31.4 
 
 		 490 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  34.07 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  31 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.61 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.74 
 
 		 132 aa  47.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  41.07 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  34.12 
 
 		 324 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.67 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  36.25 
 
 		 311 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.68 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  32.94 
 
 		 317 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  31.18 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  32.94 
 
 		 318 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  32.94 
 
 		 318 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.07 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13554  hypothetical protein  35.05 
 
 		 334 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.61 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  32.41 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.61 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.61 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.61 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.61 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.61 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  31.06 
 
 		 474 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  34.69 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  31.46 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  40.98 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  27.45 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1538  hypothetical protein  30.39 
 
 		 332 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  30.93 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  34.83 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 913 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.91 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  31.25 
 
 		 541 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  36.76 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  34.09 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  24.27 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  36.76 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  31.73 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  38.64 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  37.14 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.42 
 
 		 132 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>