More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0424 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
380 aa  741    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  68.7 
 
 
371 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  44.5 
 
 
375 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
366 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  40.82 
 
 
382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
371 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  41.96 
 
 
417 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
376 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
374 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 
370 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 
385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  41.89 
 
 
370 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  40.89 
 
 
366 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
394 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
373 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  43.19 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
435 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
378 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  42.16 
 
 
395 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
394 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  37.95 
 
 
400 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
366 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 
380 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
393 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  40.89 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
370 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
420 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
380 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  37.46 
 
 
408 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
367 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
381 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  40.28 
 
 
431 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.95 
 
 
381 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
378 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
395 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 
398 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
371 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.42 
 
 
381 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
386 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  38.21 
 
 
373 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
382 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
437 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
381 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  32.22 
 
 
380 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  38.24 
 
 
346 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
346 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  34.01 
 
 
336 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
384 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
381 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 
381 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
535 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
444 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
387 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
374 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
376 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
387 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  34.61 
 
 
380 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  29.77 
 
 
374 aa  146  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
376 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
390 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  34.34 
 
 
381 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.6 
 
 
375 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
524 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.67 
 
 
351 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
381 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
372 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
375 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
381 aa  142  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.06 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
377 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
360 aa  139  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  29.47 
 
 
430 aa  139  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
374 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  41.34 
 
 
394 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
381 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
376 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  37.32 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.06 
 
 
361 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  36.06 
 
 
361 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
428 aa  136  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
384 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.18 
 
 
374 aa  136  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.06 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.06 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.06 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.06 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.06 
 
 
401 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.19 
 
 
375 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
364 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>