262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0423 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  83.89 
 
 
211 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  68.25 
 
 
211 aa  292  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.2 
 
 
213 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.29 
 
 
214 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.29 
 
 
214 aa  278  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.61 
 
 
213 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  65.71 
 
 
212 aa  274  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.59 
 
 
229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.51 
 
 
213 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.33 
 
 
214 aa  270  9e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.16 
 
 
213 aa  270  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  64.15 
 
 
214 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.56 
 
 
213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.21 
 
 
214 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.21 
 
 
214 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  63.21 
 
 
214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.74 
 
 
214 aa  264  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.37 
 
 
212 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.74 
 
 
214 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.43 
 
 
212 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.26 
 
 
214 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.95 
 
 
212 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.38 
 
 
217 aa  260  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
214 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
214 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.32 
 
 
265 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
214 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
214 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
214 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
214 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  61.79 
 
 
214 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  60.95 
 
 
210 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.29 
 
 
215 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.52 
 
 
212 aa  248  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.87 
 
 
215 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.57 
 
 
212 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  59.81 
 
 
217 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.94 
 
 
217 aa  246  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.98 
 
 
211 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.4 
 
 
215 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.62 
 
 
212 aa  244  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.3 
 
 
212 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.3 
 
 
212 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2931  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  59.05 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.08 
 
 
215 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.87 
 
 
215 aa  235  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  62.12 
 
 
202 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.55 
 
 
215 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.03 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.55 
 
 
215 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.03 
 
 
239 aa  231  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3713  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.94 
 
 
226 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  58.37 
 
 
214 aa  231  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.02 
 
 
211 aa  229  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.13 
 
 
215 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.08 
 
 
215 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.13 
 
 
215 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.18 
 
 
215 aa  229  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.98 
 
 
211 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1481  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.97 
 
 
217 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  0.265561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.14 
 
 
261 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.46 
 
 
217 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3944  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.98 
 
 
215 aa  225  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000793587  normal  0.125259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.81 
 
 
224 aa  225  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.19 
 
 
215 aa  225  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.63 
 
 
214 aa  225  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.3 
 
 
211 aa  224  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.71 
 
 
239 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.98 
 
 
217 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.448099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.67 
 
 
221 aa  222  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.08 
 
 
215 aa  221  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2564  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  54.03 
 
 
212 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.252364  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2803  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.19 
 
 
225 aa  221  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00595972  normal  0.551671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.48 
 
 
212 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.18 
 
 
215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  55.45 
 
 
218 aa  218  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.55 
 
 
217 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  57.14 
 
 
201 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752106  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.46 
 
 
225 aa  215  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2059  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  52.29 
 
 
258 aa  214  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0352298  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.14 
 
 
213 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3130  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  56.41 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  0.139192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1992  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.45 
 
 
213 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.11 
 
 
212 aa  211  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01070  pyridoxamine-phosphate oxidase, putative  52.09 
 
 
268 aa  211  9e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  47.64 
 
 
212 aa  210  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33810  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.01 
 
 
222 aa  209  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.3 
 
 
200 aa  208  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  47.85 
 
 
215 aa  208  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  47.85 
 
 
215 aa  208  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0501  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.06 
 
 
219 aa  208  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.48 
 
 
218 aa  207  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2606  pyridoxal 5'-phosphate synthase  46.67 
 
 
213 aa  207  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.78 
 
 
225 aa  207  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.48 
 
 
218 aa  207  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0734  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  53.55 
 
 
213 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.87 
 
 
233 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  50.97 
 
 
210 aa  205  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.85 
 
 
217 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>