More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0414 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
400 aa  790    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71017  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.49 
 
 
400 aa  760    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543295  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.33 
 
 
397 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  0.026678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
355 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
331 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  43.3 
 
 
316 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  42.53 
 
 
321 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.97 
 
 
321 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 
316 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  40.3 
 
 
316 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  40.3 
 
 
316 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
316 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3876  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.33 
 
 
336 aa  193  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  40.3 
 
 
316 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
316 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.16 
 
 
316 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.16 
 
 
316 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 
335 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238126  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
326 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
332 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
322 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.77 
 
 
320 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
319 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
321 aa  186  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 
335 aa  186  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
320 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0307537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
319 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
319 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
318 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
321 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
321 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 
336 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
307 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.301395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  38.85 
 
 
318 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
318 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
322 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
318 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
319 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
319 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  40.77 
 
 
319 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  40.46 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
319 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.692549  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
321 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.61 
 
 
333 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
343 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
326 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.86 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.58 
 
 
343 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 
331 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00166089  hitchhiker  0.0087818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
318 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
326 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
334 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
325 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
320 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
320 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
324 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
321 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
308 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.31 
 
 
345 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  39.69 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.69 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  39.69 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.52 
 
 
336 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.52 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  40.46 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.34 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
305 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  38.89 
 
 
339 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 
319 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
328 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00108438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  38.91 
 
 
324 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  37.23 
 
 
339 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
349 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
334 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
349 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
358 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
314 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.64 
 
 
307 aa  169  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
326 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 
319 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
321 aa  169  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  38.15 
 
 
339 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  38.15 
 
 
339 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  38.15 
 
 
339 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
321 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  38.15 
 
 
339 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>