28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0399 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  877    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1027  hypothetical protein  77.47 
 
 		 464 aa  600  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  45.15 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  45.31 
 
 		 508 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  30.85 
 
 		 654 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  26.74 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.22 
 
 		 1276 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  28.83 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  27.12 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  28.62 
 
 		 801 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.13 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.87 
 
 		 604 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.16 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  23.65 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  27.09 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  23.97 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.18 
 
 		 605 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  34.53 
 
 		 550 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  40.22 
 
 		 550 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  23.28 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25.93 
 
 		 662 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  28.95 
 
 		 891 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  30.07 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  25.32 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  21.38 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  21.52 
 
 		 1141 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  22.7 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>