More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0390 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  94.57 
 
 		 272 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  68.15 
 
 		 272 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.13 
 
 		 271 aa  328  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.55 
 
 		 281 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.94 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.43 
 
 		 314 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.62 
 
 		 267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.49 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.86 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.36 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.81 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.23 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.23 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.19 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.3 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.07 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.75 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 272 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 272 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.63 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.53 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.42 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.46 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 		 274 aa  188  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.95 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.95 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.17 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.91 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 		 272 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  39.93 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 		 260 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 272 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 		 280 aa  178  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.83 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  39.18 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.07 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  43.94 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.91 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 272 aa  175  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.55 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.32 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.67 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>