27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0370 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  704    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146406  unclonable  0.0000143605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0193  hypothetical protein  78.09 
 
 		 329 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1432  hypothetical protein  35.76 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1295  hypothetical protein  36.09 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2483  hypothetical protein  33.87 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1779  hypothetical protein  37 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1983  conserved hypothetical cytosolic protein  33.14 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0747  hypothetical protein  34.85 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2062  hypothetical protein  34.33 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1257  conserved hypothetical cytosolic protein  33.13 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1350  hypothetical protein  32.05 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2838  conserved hypothetical cytosolic protein  32.54 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.445341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0568  hypothetical protein  30.09 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.937151  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5080  hypothetical protein  30.09 
 
 		 319 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3302  hypothetical protein  30.89 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2514  hypothetical protein  27.71 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.25837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1869  hypothetical protein  30.34 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2802  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3261  hypothetical protein  28.3 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3253  hypothetical protein  24.44 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2394  hypothetical protein  28.48 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0632  hypothetical protein  30.67 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1179  hypothetical protein  28.41 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3249  hypothetical protein  24.77 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2056  hypothetical protein  27.05 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1011  hypothetical protein  24.38 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2211  hypothetical protein  25.6 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>