15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0369 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  100 
 
 		 724 aa  1485    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  71.98 
 
 		 727 aa  1032    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2384  Crm2 family CRISPR-associated protein  31.34 
 
 		 776 aa  304  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  28.86 
 
 		 547 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  23.35 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  23.72 
 
 		 710 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1805  hypothetical protein  25.12 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  25.23 
 
 		 545 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  28.8 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  28.02 
 
 		 607 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 823 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  24.57 
 
 		 542 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  23.58 
 
 		 542 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0106  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  27.13 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  28 
 
 		 488 aa  43.9  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>