72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0329 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0329  stage V sporulation protein S  100 
 
 
113 aa  219  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000741816  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0857  stage V sporulation protein S  97.35 
 
 
113 aa  213  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000382647  normal  0.012678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3712  Stage V sporulation protein S  78.38 
 
 
111 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000458121  unclonable  0.0000000156337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4794  stage V sporulation protein S  86.36 
 
 
116 aa  150  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000730393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1623  stage V sporulation protein S  65.88 
 
 
86 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00229397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0800  Stage V sporulation protein S  65.88 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000455858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1476  Stage V sporulation protein S  63.53 
 
 
86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0395044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1063  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000086258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1250  stage V sporulation protein S  60 
 
 
86 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1473  Stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.647182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2088  Stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1193  Stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1916  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.431048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3098  Stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0824  Stage V sporulation protein S  68.29 
 
 
88 aa  114  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000326249  decreased coverage  0.000000165948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3101  Stage V sporulation protein S  62.35 
 
 
86 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424349  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0579  Stage V sporulation protein S  62.35 
 
 
86 aa  114  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00801722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1035  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.477412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3823  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3875  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3547  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00463585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1424  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498472  normal  0.676354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3788  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3811  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2428  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3535  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000915983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3912  stage v sporulation protein s  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3517  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3625  stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00154447  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0122  stage V sporulation protein S  62.35 
 
 
87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0150  stage V sporulation protein S  63.53 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000295872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1364  Stage V sporulation protein S  60 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000230585  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1692  stage V sporulation protein S  63.41 
 
 
87 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1749  stage V sporulation protein S  63.41 
 
 
87 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11860  Stage V sporulation protein S  62.35 
 
 
86 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0673325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1084  stage V sporulation protein S  60 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00542046  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10760  hypothetical protein  60 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.276427  unclonable  0.0000000010918 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0756  stage V sporulation protein S  60.98 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000223874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0732  stage V sporulation protein S  60.98 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000194114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1477  Stage V sporulation protein S  61.18 
 
 
86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429991  normal  0.870464 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1643  stage V sporulation protein S  56.47 
 
 
86 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1925  stage V sporulation protein S  56.47 
 
 
86 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1089  stage V sporulation protein S  54.76 
 
 
88 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0952  stage V sporulation protein S  58.82 
 
 
86 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.842093  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3154  stage V sporulation protein S  57.65 
 
 
91 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2160  stage V sporulation protein S  57.65 
 
 
91 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1977  stage V sporulation protein S  56.47 
 
 
91 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00430214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1997  stage V sporulation protein S  58.82 
 
 
91 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0714097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0689  Stage V sporulation protein S  55.29 
 
 
86 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2004  stage V sporulation protein S  56.47 
 
 
91 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2301  stage V sporulation protein S  56.47 
 
 
91 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2185  stage V sporulation protein S  56.47 
 
 
91 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1956  stage V sporulation protein S  56.47 
 
 
91 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2154  stage v sporulation protein s  56.47 
 
 
91 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07240  Stage V sporulation protein S  55.29 
 
 
86 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000480273  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1615  Stage V sporulation protein S  53.33 
 
 
116 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000469458  hitchhiker  0.00000000000012746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2222  stage V sporulation protein S  55.29 
 
 
90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.359972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1718  stage V sporulation protein S  54.12 
 
 
86 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0837421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0929  stage V sporulation protein S  57.65 
 
 
86 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000157372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07440  hypothetical protein  56.98 
 
 
109 aa  100  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000332095  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1164  Stage V sporulation protein S  52.94 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1701  Stage V sporulation protein S  48.19 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.287467  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0775  Stage V sporulation protein S  54.32 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00411113  normal  0.0988549 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0439  stage V sporulation protein S  49.41 
 
 
86 aa  92  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2738  Stage V sporulation protein S  48.24 
 
 
86 aa  90.9  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1803  Stage V sporulation protein S  48.78 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444182  normal  0.321654 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1040  stage V sporulation protein S  53.66 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00126315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0030  stage V sporulation protein S  52.44 
 
 
91 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000272981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0030  stage V sporulation protein S  52.44 
 
 
91 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000573648  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0037  stage V sporulation protein S  50 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000556639  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1283  stage V sporulation protein S  51.19 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.597685  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0612  Stage V sporulation protein S  39.08 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>