More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0328 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  88.24 
 
 		 311 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  55.34 
 
 		 318 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  46.36 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  45.64 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  44.63 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  40.96 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  39.44 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  43.55 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  36.08 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  34.23 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  35.4 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  34.45 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  38.41 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  34.3 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  29.79 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  29.79 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  32.78 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  35.56 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  35.65 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  28.14 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  34.74 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  36.5 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  39.68 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  28.14 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  31.05 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  38.17 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  37.74 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  34.28 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  36.64 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  34.97 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  34.81 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  33.13 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  33.12 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  37.36 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  37.36 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  37.4 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 307 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  27.4 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  36.6 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  34.67 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  37.17 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  35.64 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  27.4 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  35.5 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  36.33 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  36.86 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  38.17 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  34.56 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  35.6 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  34.73 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  37.69 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  32.58 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.35 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.59 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  34.32 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  36.16 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  34.11 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  32.22 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  37.81 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  31.69 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  36.74 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.68 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  31.69 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  37.66 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.27 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.09 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  34.83 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.21 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  35.93 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  31.08 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  35.02 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  32.49 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.49 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.83 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  33.76 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>