More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0316 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  80.47 
 
 		 258 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  62 
 
 		 271 aa  318  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  57.6 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  48.22 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  51.98 
 
 		 261 aa  242  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  47.64 
 
 		 464 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  50.99 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  42.29 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  48.46 
 
 		 462 aa  234  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  44.27 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  43.87 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  43.87 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.87 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.87 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  45.67 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  43.48 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  43.48 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.08 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  49.01 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  43.08 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.08 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  44.66 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  48.08 
 
 		 606 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  41.9 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  47.62 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  42.29 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41.9 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  45.06 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 462 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  42.86 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  42.8 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  46.85 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  45.49 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  48.41 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  43.53 
 
 		 458 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  47.29 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  40.94 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  40.94 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  41.9 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  45.02 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 		 458 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  49.41 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  39.29 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  44.88 
 
 		 457 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  40.16 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  38.49 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  38.4 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  40.16 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  39.22 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  39.2 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.22 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  39.68 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  44.66 
 
 		 461 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  38.8 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  41.94 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  38.1 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  37.15 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  43.08 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  39.06 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  44.84 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  38.49 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  44.22 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  38.98 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  41.6 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  42.13 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  43.56 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  43.33 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  42.35 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  41.83 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  40.47 
 
 		 454 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  41.02 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  46.03 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  43.53 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  38.02 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  38.82 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  39.61 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  41.44 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  40.16 
 
 		 255 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  42.8 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  40.16 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  41.43 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  42.29 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  39.31 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  41.5 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  40.55 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>