76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0300 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  58.55 
 
 
201 aa  226  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  60.64 
 
 
223 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  55.9 
 
 
197 aa  200  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  51.5 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  51.69 
 
 
220 aa  191  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  54.59 
 
 
206 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  47.27 
 
 
239 aa  185  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  50 
 
 
196 aa  184  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  53.33 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  49.43 
 
 
219 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  48.28 
 
 
185 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  46.41 
 
 
179 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  44.28 
 
 
204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  46.29 
 
 
174 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  44 
 
 
163 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  49.11 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  44 
 
 
163 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  46.2 
 
 
168 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  44.2 
 
 
203 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  39.74 
 
 
232 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  41.75 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  45.2 
 
 
203 aa  151  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  45.31 
 
 
197 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  43.17 
 
 
200 aa  148  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  40.93 
 
 
199 aa  140  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  39.8 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  41.48 
 
 
187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  40.33 
 
 
192 aa  137  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  39.37 
 
 
221 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  40.72 
 
 
198 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  41.71 
 
 
197 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  37.56 
 
 
224 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  40.66 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  127  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  36.6 
 
 
251 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  35.05 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  36.11 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  47.97 
 
 
127 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  50.6 
 
 
107 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  42 
 
 
258 aa  85.1  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  45.88 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  29.76 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  37.66 
 
 
129 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  28.74 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  25.47 
 
 
151 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  27.22 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  30.16 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  24.1 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  28.67 
 
 
163 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  25.15 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  26.17 
 
 
150 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  27.84 
 
 
153 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  29.25 
 
 
150 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  24.66 
 
 
151 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  21.92 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  25.66 
 
 
184 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  27.27 
 
 
175 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  25.62 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  22.02 
 
 
151 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  27.92 
 
 
171 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  22.42 
 
 
151 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  24.34 
 
 
163 aa  44.7  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  22.84 
 
 
150 aa  44.7  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  22.93 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  25.95 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.87 
 
 
1345 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.87 
 
 
1372 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  34.38 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  23.84 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  25.66 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  23.78 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  23.17 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  23.23 
 
 
178 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>