147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0299 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 1154 aa  2376    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  42.69 
 
 		 1209 aa  798    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  44.99 
 
 		 1338 aa  849    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  36.16 
 
 		 1132 aa  596  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  34.72 
 
 		 1076 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1147 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1177 aa  410  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1210 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1120 aa  345  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1036 aa  343  9e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  40.52 
 
 		 1299 aa  343  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1039 aa  323  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  30.67 
 
 		 995 aa  323  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  28.72 
 
 		 1257 aa  288  4e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1426 aa  281  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  29.11 
 
 		 1244 aa  278  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  33.87 
 
 		 1159 aa  245  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  25.16 
 
 		 1170 aa  225  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1178 aa  217  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.33 
 
 		 974 aa  212  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1612 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.62 
 
 		 1256 aa  164  8.000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.1 
 
 		 1252 aa  152  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.22 
 
 		 1432 aa  149  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1184 aa  138  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  23.21 
 
 		 1058 aa  132  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  33.46 
 
 		 1089 aa  130  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.64 
 
 		 1194 aa  127  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1298 aa  124  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  25.72 
 
 		 410 aa  121  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1104 aa  119  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  21.63 
 
 		 1020 aa  114  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  27.11 
 
 		 562 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  25.12 
 
 		 557 aa  108  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  28.49 
 
 		 1186 aa  106  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  26.65 
 
 		 518 aa  105  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.05 
 
 		 950 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1088 aa  102  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  32.7 
 
 		 247 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  24.35 
 
 		 629 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  24.01 
 
 		 882 aa  99.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1290 aa  94.7  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1282 aa  90.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1338 aa  80.1  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  26.83 
 
 		 838 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  28.22 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  23.2 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1365 aa  78.2  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1452 aa  77.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  23.39 
 
 		 1277 aa  77  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1339 aa  77.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.44 
 
 		 836 aa  76.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1366 aa  75.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25.26 
 
 		 527 aa  74.3  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1422 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1243 aa  73.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.89 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  23.89 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2063  hypothetical protein  27.24 
 
 		 332 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0829013  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  20.77 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1373 aa  68.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  35.65 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  33.75 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1332 aa  66.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1250 aa  65.1  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.7 
 
 		 1278 aa  65.1  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1363 aa  64.7  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1333 aa  64.7  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  27.2 
 
 		 1319 aa  64.3  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  31.76 
 
 		 652 aa  64.3  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1250 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  21.07 
 
 		 1241 aa  62.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1339 aa  62.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1339 aa  62.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1231 aa  62.4  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1353 aa  62  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1324 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  23.81 
 
 		 1336 aa  60.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  25.6 
 
 		 1219 aa  61.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  23.44 
 
 		 1343 aa  60.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  37.08 
 
 		 573 aa  60.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1342 aa  60.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  24.91 
 
 		 1306 aa  59.3  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  25.84 
 
 		 1358 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1497 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  28.11 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3037  hypothetical protein  23.92 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  23 
 
 		 1189 aa  58.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 		 1322 aa  58.5  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1484 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  25.36 
 
 		 1712 aa  57.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1209 aa  57.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  28.71 
 
 		 539 aa  57  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1347 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1347 aa  56.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1459 aa  56.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  23.36 
 
 		 1331 aa  56.2  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  32.09 
 
 		 816 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  25.09 
 
 		 1318 aa  56.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  36.78 
 
 		 595 aa  55.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>