More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0288 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  83.38 
 
 
652 aa  1098  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  100 
 
 
651 aa  1326  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  49.46 
 
 
645 aa  612  1e-174  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  44.12 
 
 
655 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  37.74 
 
 
623 aa  402  1e-110  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  35.07 
 
 
590 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.38 
 
 
605 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  35.07 
 
 
590 aa  364  3e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  33.82 
 
 
588 aa  353  5e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.07 
 
 
599 aa  338  2e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.71 
 
 
626 aa  331  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.93 
 
 
588 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.88 
 
 
587 aa  317  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.58 
 
 
587 aa  316  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  33.88 
 
 
600 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  40 
 
 
601 aa  309  1e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  38.49 
 
 
605 aa  298  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.64 
 
 
614 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.36 
 
 
604 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  40.05 
 
 
682 aa  295  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.84 
 
 
604 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.5 
 
 
613 aa  293  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  37.36 
 
 
675 aa  293  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  37.44 
 
 
593 aa  293  7e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.48 
 
 
598 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.47 
 
 
588 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40.05 
 
 
599 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.61 
 
 
582 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.08 
 
 
583 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  37.68 
 
 
601 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  37.27 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  36.12 
 
 
574 aa  288  3e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  31.55 
 
 
578 aa  288  3e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.3 
 
 
595 aa  287  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  39.72 
 
 
686 aa  287  5e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.87 
 
 
675 aa  286  6e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.47 
 
 
595 aa  286  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  30.53 
 
 
599 aa  286  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  36.07 
 
 
646 aa  285  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  36.07 
 
 
646 aa  285  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.07 
 
 
595 aa  283  5e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  36.72 
 
 
690 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  38.13 
 
 
640 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  32.6 
 
 
584 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  38.41 
 
 
641 aa  280  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.34 
 
 
598 aa  279  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.25124e-06  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.34 
 
 
598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.11 
 
 
598 aa  278  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.94887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.11 
 
 
598 aa  278  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.11 
 
 
571 aa  278  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.16 
 
 
598 aa  278  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.11 
 
 
598 aa  278  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.16 
 
 
598 aa  278  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  39.08 
 
 
611 aa  277  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  38.57 
 
 
684 aa  277  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  39.47 
 
 
564 aa  276  7e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.11 
 
 
598 aa  275  1e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.52 
 
 
655 aa  276  1e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.71 
 
 
600 aa  275  2e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.13 
 
 
638 aa  275  2e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.1 
 
 
663 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  36.36 
 
 
604 aa  274  4e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.71 
 
 
664 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  36.79 
 
 
617 aa  273  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.25 
 
 
605 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.25 
 
 
605 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.17 
 
 
651 aa  271  3e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  36.88 
 
 
656 aa  270  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  35.62 
 
 
634 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.71 
 
 
660 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  38.28 
 
 
660 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  37.56 
 
 
660 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37.32 
 
 
660 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  33.74 
 
 
573 aa  268  3e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.6 
 
 
592 aa  267  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  32.61 
 
 
617 aa  267  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.17 
 
 
652 aa  267  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.39 
 
 
663 aa  266  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  36.34 
 
 
679 aa  266  9e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  37.5 
 
 
598 aa  266  9e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  38.78 
 
 
694 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  32.99 
 
 
596 aa  266  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  35.65 
 
 
603 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  32.23 
 
 
577 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  36.99 
 
 
614 aa  265  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  37.09 
 
 
618 aa  264  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  35.93 
 
 
636 aa  264  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  36.67 
 
 
587 aa  264  5e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  36.12 
 
 
636 aa  263  7e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  36.65 
 
 
603 aa  263  9e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  36.49 
 
 
639 aa  260  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  34.85 
 
 
676 aa  259  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  38.22 
 
 
587 aa  259  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  34.19 
 
 
567 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.61 
 
 
619 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  34.55 
 
 
613 aa  257  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  32.98 
 
 
588 aa  257  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  32.47 
 
 
624 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36.36 
 
 
579 aa  256  1e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  34.46 
 
 
653 aa  255  1e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>