More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0241 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  96.72 
 
 		 274 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  90.51 
 
 		 270 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  97.07 
 
 		 274 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  96.72 
 
 		 274 aa  504  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  96.34 
 
 		 274 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  94.16 
 
 		 274 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  93.43 
 
 		 274 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  94.53 
 
 		 274 aa  495  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  92.7 
 
 		 274 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  47.58 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  43.46 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  47.56 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  47.56 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  40.37 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  44.23 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  40.81 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  41.09 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  41.76 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  40.86 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  40.86 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  42.12 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  37.78 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  37.78 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  37.78 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  42.58 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  39.3 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  42.19 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  39.53 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  41.39 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  42.05 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  42.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  42.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  42.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  42.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  42.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  42.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  42.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  42.67 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  35.11 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  41.88 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  42.55 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  40.55 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  37.36 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  36.94 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 250 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  39.53 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  39.53 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  39.53 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  39.53 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  39.53 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  43.59 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  36.43 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  36.09 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  38.58 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  39.68 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  38.01 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  48 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  37.83 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  37.83 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  37.83 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  37.83 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  37.83 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  37.97 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  38.18 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  38.18 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  38.18 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  38.06 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  38.06 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  38.06 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  38.06 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  38.06 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  38.06 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>