More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0169 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  78.57 
 
 
259 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  57.38 
 
 
257 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  57.76 
 
 
242 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.85 
 
 
259 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  55.79 
 
 
253 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  55.46 
 
 
252 aa  248  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  55.13 
 
 
246 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.58 
 
 
256 aa  244  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.62 
 
 
243 aa  243  2e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.94 
 
 
264 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.47 
 
 
270 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 
249 aa  240  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.65 
 
 
244 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  55.93 
 
 
271 aa  239  3e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  48.93 
 
 
254 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.77 
 
 
246 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  53.19 
 
 
255 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  52.77 
 
 
255 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.62 
 
 
270 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.77 
 
 
250 aa  235  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  54.7 
 
 
258 aa  234  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.52 
 
 
266 aa  233  2e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  54.55 
 
 
252 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  55.35 
 
 
251 aa  232  4e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  55.35 
 
 
247 aa  232  4e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  55.35 
 
 
247 aa  232  4e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.52 
 
 
250 aa  231  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.51 
 
 
255 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
254 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 
255 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
249 aa  222  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 
249 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.84786e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.3 
 
 
277 aa  212  4e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  45.42 
 
 
398 aa  212  4e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  42.98 
 
 
282 aa  211  6e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.84 
 
 
273 aa  212  6e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.82859e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.4 
 
 
256 aa  211  8e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 
276 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  46.32 
 
 
239 aa  209  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
411 aa  209  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 
278 aa  208  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 
403 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 
278 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 
284 aa  206  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.76304e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.16 
 
 
281 aa  205  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 
281 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.73 
 
 
277 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.73 
 
 
288 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.68 
 
 
284 aa  201  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
395 aa  201  1e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.7 
 
 
277 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.96 
 
 
281 aa  198  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  43.72 
 
 
240 aa  197  1e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  43.72 
 
 
244 aa  196  2e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  43.35 
 
 
239 aa  196  4e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
283 aa  196  4e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.83 
 
 
310 aa  195  5e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 
402 aa  195  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  41.35 
 
 
263 aa  195  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.08 
 
 
256 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  7.2763e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
440 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  2.92327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 
243 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
541 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 
453 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
456 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  38.33 
 
 
283 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  44.12 
 
 
380 aa  189  3e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.68 
 
 
285 aa  189  3e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  42.68 
 
 
571 aa  189  3e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 
281 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.27 
 
 
285 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
276 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 
403 aa  184  1e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
284 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 
285 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
285 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 
244 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.34 
 
 
291 aa  179  3e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.4 
 
 
261 aa  179  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  47.64 
 
 
218 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.47 
 
 
270 aa  178  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
255 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
286 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.82138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  40.08 
 
 
280 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
276 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  38.3 
 
 
283 aa  175  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.23426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  38.3 
 
 
283 aa  175  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  48.82 
 
 
214 aa  173  2e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  38.98 
 
 
278 aa  173  3e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.68 
 
 
277 aa  172  4e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5399e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  38.84 
 
 
290 aa  172  4e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 
271 aa  172  4e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
274 aa  172  6e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  42.49 
 
 
265 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
279 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 
285 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  42.02 
 
 
269 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  38.11 
 
 
283 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  38.86 
 
 
244 aa  168  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>