More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0114 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  100 
 
 
229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  93.48 
 
 
230 aa  424  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.38 
 
 
235 aa  295  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  59.03 
 
 
231 aa  258  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.89 
 
 
229 aa  254  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 
231 aa  230  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 
229 aa  229  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  57.46 
 
 
232 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 
231 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 
231 aa  224  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 
234 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  48.92 
 
 
238 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 
229 aa  223  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  54.26 
 
 
229 aa  222  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 
246 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  52.56 
 
 
239 aa  221  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  52.56 
 
 
239 aa  221  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 
232 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  52.36 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  54.87 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.7 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  50 
 
 
234 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 
235 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 
230 aa  218  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 
239 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
234 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  54.26 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  51.5 
 
 
239 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  51.5 
 
 
239 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 
246 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  53.95 
 
 
232 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 
230 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 
228 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 
246 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  51.5 
 
 
239 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 
233 aa  216  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
232 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 
235 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 
235 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 
234 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 
235 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 
238 aa  215  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  48.43 
 
 
256 aa  215  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  49.56 
 
 
235 aa  215  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 
235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  49.56 
 
 
235 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  49.56 
 
 
235 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  49.56 
 
 
235 aa  214  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  49.56 
 
 
235 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  49.56 
 
 
235 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  49.56 
 
 
235 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
235 aa  214  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  49.56 
 
 
235 aa  214  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 
251 aa  211  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
238 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 
235 aa  210  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  47.58 
 
 
227 aa  209  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 
237 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  51.98 
 
 
251 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 
240 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 
230 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 
239 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 
230 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
237 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 
234 aa  208  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 
236 aa  208  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
233 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  51.35 
 
 
244 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  51.35 
 
 
244 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  47.53 
 
 
230 aa  207  8e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  46.7 
 
 
227 aa  207  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  46.75 
 
 
236 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  46.26 
 
 
237 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 
234 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.1 
 
 
231 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 
231 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 
234 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 
237 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 
230 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
250 aa  205  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 
321 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.35 
 
 
243 aa  204  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
230 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 
236 aa  204  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  45.81 
 
 
237 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 
242 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  48.9 
 
 
235 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
237 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
227 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  52.86 
 
 
248 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
239 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
237 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>