More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0094 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0094  peptidase M20  100 
 
 		 448 aa  905    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0196  peptidase M20  86.1 
 
 		 448 aa  781    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2415  peptidase M20  49.32 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2833  peptidase M20  41.47 
 
 		 443 aa  336  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.03601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.89 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  32.36 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  33.17 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  31.45 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2697  peptidase M20  32.86 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.922328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  33.17 
 
 		 448 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0692  peptidase M20  27.34 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.74 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  31.67 
 
 		 418 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  26.71 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  24.77 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  27.38 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  31.51 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  27.71 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4109  peptidase M20  29.84 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  25.17 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.7 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.55 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0916  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.4 
 
 		 521 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.67 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  29.06 
 
 		 455 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  29.03 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.91 
 
 		 475 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  25.81 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  27.27 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  26.36 
 
 		 462 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  31.4 
 
 		 467 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  28.64 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  28.64 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.69 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  30.28 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  28.61 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0937  peptidase M20  27.33 
 
 		 450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0137436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  26.92 
 
 		 458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2145  peptidase M20  31.01 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0790004  normal  0.0404303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  27.61 
 
 		 463 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  26.9 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  28.45 
 
 		 462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  27.76 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  27.55 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  26.19 
 
 		 508 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  25.77 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  26.01 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.03 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  27.19 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  27.37 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  25.43 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  29.12 
 
 		 484 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  29.75 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  25 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  25.27 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  25.6 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0372  twin-arginine translocation pathway signal  28.86 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  27.32 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  24.77 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  28.74 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  26.96 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  26.88 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  24.6 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  26.59 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  27.97 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  27.97 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  29.2 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  24.72 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  29.39 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  26.83 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  29.81 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.38 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3870  peptidase M20  28.93 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0529091  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04170  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 988 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  28.66 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  27 
 
 		 496 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  28.66 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  26.74 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  25.62 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  27.93 
 
 		 479 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  24.24 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  24.28 
 
 		 457 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  29.03 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  27.22 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  29.57 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  29.57 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  29.57 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  29.78 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  28.53 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  23.1 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  28.18 
 
 		 468 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  28.43 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  27.44 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  27.04 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  29.73 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  27.2 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  26.32 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  26.29 
 
 		 467 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  26.78 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  28.12 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>