16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0086 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 100 aa  199  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  38.61 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  34.31 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  38.27 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0706  DNA polymerase beta subunit  40.79 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2490  DNA polymerase beta domain protein region  26 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  30.49 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3842  DNA polymerase beta subunit  34.94 
 
 		 127 aa  42  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0515  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0793119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  29.59 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  35.71 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  30.12 
 
 		 111 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>