30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0084 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0084  HEPN domain-containing protein  100 
 
 
107 aa  220  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395692  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0500  hypothetical protein  43.82 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1919  HEPN domain-containing protein  40.22 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391131 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0075  HepN domain protein  34.41 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535733  normal  0.629451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3040  HEPN domain-containing protein  39.13 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0237  HEPN domain-containing protein  34.83 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2668  HEPN domain protein  35.71 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2146  HEPN domain protein  37.78 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1027  HEPN domain protein  32.26 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000217763  normal  0.602077 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0103  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120432  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0039  HepN domain protein  33.33 
 
 
137 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108662 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0034  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3437  HEPN domain-containing protein  35.71 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2346  HEPN domain-containing protein  42.86 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048246  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0062  HepN domain protein  33.33 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4090  HEPN domain-containing protein  35.42 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.418783  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4128  HEPN domain-containing protein  36.26 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124069 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0040  HEPN domain protein  34.74 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0573  HEPN domain-containing protein  35.79 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168783  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0217  HEPN  40.32 
 
 
133 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121698  hitchhiker  0.00000000000000140907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1302  HEPN domain-containing protein  34.78 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0705  HEPN domain-containing protein  35.42 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0171  HEPN domain-containing protein  31.87 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3921  HEPN domain-containing protein  30.77 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.063981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2192  HEPN domain-containing protein  33.7 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.208434  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3847  HEPN domain-containing protein  39.34 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000584518  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0575  HEPN domain-containing protein  31.18 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1136  HEPN domain-containing protein  32.99 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.174489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1131  HEPN domain-containing protein  38.04 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1045  HEPN domain-containing protein  32.97 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>