70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0080 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  92.86 
 
 		 131 aa  239  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  52.38 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1673  death-on-curing family protein  49.52 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.869011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  36.89 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  32.54 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  32.79 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  28.8 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  29.03 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  37.78 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  28.8 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  28.23 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  33.87 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  28.23 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  39.08 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  31.2 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  29.27 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  29.92 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  28.1 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  27.42 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  33.04 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  30 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  26.02 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  34.78 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  27.27 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  29.03 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  25.22 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  30.51 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  30.36 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  26.83 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  30.36 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  34.15 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  26.23 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  23.58 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  33.03 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  25.41 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  26.79 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  35.62 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  32.98 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  28.7 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  35.9 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  27.27 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  36.67 
 
 		 336 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  24.39 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  30.36 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  30.91 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  34.38 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  29.82 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  24.59 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  24.19 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  26.5 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  30.69 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.85 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  26.47 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  35.19 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  25.81 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  35 
 
 		 330 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  26.13 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  27.27 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  27.27 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.51 
 
 		 186 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  31.46 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 334 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  26.45 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  29.89 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  31.34 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  29.47 
 
 		 332 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  33.67 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>