208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0062 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  676  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  86.9 
 
 
336 aa  598  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  45.14 
 
 
337 aa  303  3e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
355 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.48 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  29.67 
 
 
354 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  30.06 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.27 
 
 
346 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 
324 aa  82.8  7e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 
324 aa  81.6  2e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
335 aa  80.5  4e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
337 aa  79.3  9e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.76 
 
 
363 aa  79  1e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  29.97 
 
 
354 aa  78.2  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
327 aa  77  4e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 
324 aa  76.6  5e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
332 aa  75.9  1e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 
344 aa  75.5  1e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.48 
 
 
348 aa  74.7  2e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  25.63 
 
 
331 aa  74.7  2e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 
330 aa  73.9  3e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
340 aa  73.9  4e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 
314 aa  73.2  5e-12  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  27.76 
 
 
352 aa  72.4  1e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 
324 aa  71.2  2e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  29.05 
 
 
317 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  29.05 
 
 
317 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 
325 aa  71.2  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.09 
 
 
348 aa  70.9  3e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
317 aa  70.5  4e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  29.05 
 
 
317 aa  70.5  4e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
368 aa  70.1  5e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 
286 aa  70.1  5e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.07 
 
 
317 aa  68.9  1e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
365 aa  68.6  1e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 
321 aa  68.6  1e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
320 aa  68.9  1e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  27.3 
 
 
357 aa  67.8  2e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 
317 aa  67.4  3e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
240 aa  67  4e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 
324 aa  67  4e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.75 
 
 
317 aa  67  4e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
331 aa  67  4e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
231 aa  66.6  5e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 
339 aa  66.6  6e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  26.71 
 
 
341 aa  66.2  8e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
231 aa  65.5  1e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
345 aa  65.9  1e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.97 
 
 
317 aa  65.5  1e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 
317 aa  65.5  1e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
352 aa  63.9  3e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 
329 aa  63.5  4e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
332 aa  63.2  7e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 
328 aa  62  1e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 
324 aa  62  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97877e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
346 aa  62  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
323 aa  60.8  3e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
344 aa  60.5  4e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
321 aa  60.5  4e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  25.19 
 
 
307 aa  60.5  4e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 
349 aa  59.7  6e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 
350 aa  59.3  8e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.71524e-08  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 
371 aa  59.3  9e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  29 
 
 
359 aa  58.9  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  29 
 
 
359 aa  58.9  1e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  29 
 
 
359 aa  58.9  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  29 
 
 
359 aa  58.9  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  29 
 
 
383 aa  58.9  1e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  27.81 
 
 
365 aa  58.9  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 
349 aa  58.5  1e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  22.54 
 
 
310 aa  59.3  1e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
326 aa  58.2  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  28.62 
 
 
359 aa  57.8  2e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  28.62 
 
 
331 aa  57.4  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25.18 
 
 
328 aa  57.4  3e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  30.53 
 
 
207 aa  57.8  3e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.86838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
363 aa  57.4  3e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  26.65 
 
 
366 aa  57.8  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 
348 aa  57.4  4e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  23.05 
 
 
322 aa  57  4e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  24.03 
 
 
321 aa  56.6  6e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
287 aa  56.6  6e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 
208 aa  56.2  7e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
212 aa  55.5  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  24.38 
 
 
354 aa  54.3  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  22.04 
 
 
200 aa  53.9  4e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  26.45 
 
 
359 aa  53.5  5e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  26.86 
 
 
329 aa  53.1  6e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  26.1 
 
 
358 aa  53.1  6e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 
351 aa  52.8  8e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 
862 aa  52.8  8e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
211 aa  52.8  8e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 
205 aa  52.4  1e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  5.49236e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 
369 aa  52.4  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  25.11 
 
 
201 aa  51.6  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>